Der 44-jährige Steirer war einst Spieler bei Red Bull Salzburg bzw. beim FC Liefering (2012 bis 2014), bei dem er nach seiner Karriere auch als Kotrainer fungierte. Im Dezember 2015 wechselte Aufhauser in dieser Funktion zu Salzburg. „Mit meinem Wechsel zum FC Liefering verlasse ich ein tolles Team und tolle Kollegen, mit denen ich in den letzten fünf Jahren Großartiges erlebt habe“, wurde Aufhauser in der Aussendung des Bundesliga-Tabellenführers zitiert. Er sprach in der Liefering-Mitteilung vom „nächsten Schritt in meiner persönlichen Weiterentwicklung“.
Der langjährige ÖFB-Teamspieler ist Teil einer großen, über die österreichisch-deutschen Grenzen hinweg vollzogenen Trainerrochade. Aufhauser tritt beim aktuellen Spitzenreiter der 2. Liga die Nachfolge des Deutschen Matthias Jaissle an, der wiederum bei den Salzburgern Marsch als Trainer ersetzt. Denn der US-Amerikaner wechselt zum deutschen Bundesligisten und Fußball-„Mutterschiff“ des Konzerns von Dietrich Mateschitz RB Leipzig. Die Sachsen benötigen deshalb einen neuen Coach, weil Julian Nagelsmann ab Sommer Rekordmeister FC Bayern München trainieren wird.
Bernhard Seonbuchner, Lieferings Sportlicher Leiter, betonte, dass Aufhauser der „Wunschkandidat“ für die Jaissle-Nachfolge gewesen sei. Als ehemaliger Spieler und Assitenztrainer kenne er „unseren Verein, dessen Werte sowie – damit verbunden – unsere Spielphilosophie wie kaum ein anderer. Neben seiner internationalen Erfahrung als Spieler und Trainer in seiner bisherigen Karriere besticht Rene vor allem auch durch seine zwischenmenschliche Kompetenz“, so der Lieferinger Manager.